🧬 Comprendre et Calculer le Taux de Consanguinité (COI) : Guide Technique Pour Éleveurs

Le taux de consanguinité, ou COI (Coefficient of Inbreeding), est l’un des points les plus fondamentaux en élevage responsable.

Il permet de mesurer la probabilité que deux allèles hérités d’un chat soient identiques parce qu’ils proviennent d’un ancêtre commun.

Plus le COI est élevé ➝ plus le risque de perte de diversité génétique est important.

Plus il est faible ➝ plus les lignées sont “respirantes” et naturellement résistantes.

Ce post propose :

✔ une explication claire du COI

✔ des tableaux de combinaisons familiales courantes

✔ les limites du COI classique

✔ l’intérêt de connaitre le COI structurel d'une race.

✔ où et comment vérifier ces données dans les bases existantes (TICA, PawPeds, etc.)

📌 1. Qu’est-ce que le COI (Coefficient de Consanguinité) ?

Le COI représente la probabilité qu’un individu reçoive deux copies identiques d’un même gène provenant d’un ancêtre commun.

Exemple : Un COI de 12,5 % signifie que le chat a une probabilité de 12,5 % d’hériter de deux gènes identiques issus d’un même ancêtre.

Le COI se calcule généralement sur :

• 3 générations

• 5 générations

• 10 générations

• ou sur toute la base de données

Plus le nombre de générations est élevé, plus le résultat est fiable. Plus elle sera élévée, plus les problèmes de santé seront significatifs.

📊 2. Tableau des principales combinaisons familiales et leur COI théorique

Voici un tableau technique simple, utilisé en génétique animale pour calculer la consanguinité dite " familiale".

Combinaison	% Consanguinité
Père × Fille	25 %
Mère × Fils	25 %
Frère × Sœur (pleins frères)	25 %
Demi-frère × Demi-sœur	12,5 %
Grand-parent × Petit-enfant	12,5 %
Cousins germains	6,25 %
Cousins issus de germains	3,125 %
Arrière-grand-parent × Arrière-petit-enfant	6,25 %
Chats partageant UN ancêtre commun en 4e génération	environ 1,56 %
Chats partageant le même ancêtre en 5e génération	0,78 %

Ces chiffres représentent la consanguinité théorique, pas celle réelle. Elle peut donner une image acceptable mais en réalité , elle se cumule au COI structurel que nous allons étudier plus bas.

Le COI réel dépend :

• du nombre de fois où l’ancêtre réapparaît,

• de l’espacement entre les lignées,

• de la profondeur du pedigree.

🔍 3. Pourquoi un COI “faible”sur le pédigrée peut parfois cacher une consanguinité réelle forte ?

Le COI classique ne mesure que ce qu’il voit dans les générations analysées. Typiquement les statistiques française LOOF à propos du BENGAL - sont erronés en raison de l'absence d'une donnée significative : le COI structurel de la race.

S’il manque une partie du pedigree, le COI peut sembler faible alors que la consanguinité réelle (non déclarée) est forte voir désastreuse.

Exemple typique : Un chat utilisé dans de nombreux élevages, non déclaré comme ancêtre dans certaines lignées, peut ne pas apparaître dans les 5 générations mais revenir dans les générations 6 à 10.

➡️ Le COI à 5 générations sera faible

➡️ Le COI à 10 générations sera élevé

➡️ Le COI structurel, lui, sera très haut !

C’est pourquoi un COI n’est pertinent que si le pedigree est complet et profond.

🧩 4. Le COI structurel : un indicateur beaucoup plus fiable

Le COI structurel (ou Ancestor Loss Coefficient – ALC) ne mesure pas seulement la consanguinité.

Il mesure la perte de diversité génétique.

Il permet de savoir :

✔ combien d’ancêtres uniques apparaissent réellement

✔ combien sont réutilisés plusieurs fois

✔ si la lignée “tourne en rond”

✔ si le pedigree est saturé ou respirant

✔ si la lignée est fragile ou robuste

Exemple :

• Sur 5 générations, un chat devrait avoir 62 ancêtres uniques.

• S’il n’en a que 20, cela montre une forte utilisation répétée des mêmes ancêtres, même si le COI classique semble “correct”.

➡️ Le COI structurel détecte ce que le COI classique cache souvent.

🌐 5. Où consulter le COI et le COI structurel ?

✔ PawPeds (recommandé pour le Bengal et d'autres RACES )

La base la plus complète. Elle permet de calculer :

• COI 3 générations

• COI 10 générations

• COI TOTAL

• Ancestor Loss (COI structurel)

🔎 https://pawpeds.com

C’est la référence absolue.

✔ TICA (via pedigrees officiels)

TICA ne calcule pas le COI automatiquement.Mais les pedigrees complets permettent ensuite d’être importés dans des bases externes (PawPeds, CatPedigrees…).

✔ CatPedigrees / BengalData

Selon les pays, certaines bases privées permettent de calculer :

• COI étendu

• COI structurel

• fréquences génétiques

  
  

🛠️ 6. Comment interpréter les valeurs (guide technique)

COI (%) Structurel + COI familial	Interprétation
0–5 %	Très faible — diversité élevée
5–10 %	Bas — acceptable, bonne respiration
10–15 %	Moyen — à surveiller
15–20 %	Élevé — risque d’homogénéité génétique
20–25 %	Très élevé — attention au polygénique & immunité
>25 %	Danger — consanguinité rapprochée

Chez le Bengal, qui possède déjà une diversité limitée sur certaines lignées, il est crucial de maintenir :

➡️ un COI bas à moyen,

➡️ un COI structurel le plus haut possible en diversité (donc bas en perte d’ancêtres).

🧠 7. Comprendre la logique : COI classique + COI structurel = la vraie image

Le COI seul donne une probabilité génétique. ( nous dirons pour simplifier familial )

Le COI structurel donne une qualité de diversité.

✔ COI bas + structurel élevé ➝ CORRECT

✔ COI bas + structurel faible ➝ fausse sécurité

✔ COI haut + structurel faible ➝ lignée saturée à éviter

✔ COI moyen + structurel solide ➝ bon potentiel, diversement équilibré

🔥 8. Conclusion : Ce qu’un éleveur sérieux doit maîtriser

Un bon programme d’élevage repose sur :

• l’analyse du COI classique familial

• l’analyse du COI structurel

• la profondeur du pedigree

• l’identification des ancêtres saturés

• la compréhension des effets polygéniques et les effets sur la santé

• l’utilisation mesurée des reproducteurs populaires

• la création d’un équilibre “diversité + type” intelligent

  
  

C’est la différence entre :

🐾 multiplier les portées et

🐆 créer une lignée.